kovo 15 d. gydytojos Marijos Apeikytės pastangomis Molėtuose atidaryta pirmoji ligoninė. Ligoninėje dirbo 18 darbuotojų, iš jų 2 gydytojai, 2 medicinos seserys. Pirmoji ligoninė stovėjo dabartinio Molėtų rajono pirminės sveikatos priežiūros centro teritorijoje, tačiau 1950 metais sudegė. Po gaisro ligoninė įsikūrė dabartiniuose Molėtų Šv. apaštalų Petro ir Povilo parapijos namuose. 1953 metais pastatyta 25 lovų ligoninė, dabartinės ligoninės vietoje. 1986 metais pastatytas ligoninės pirmasis korpusas su 120 lovų dabartinės Molėtų pradinės mokyklos teritorijoje, o 1990 metų sausį baigtos ir antrojo ligoninės korpuso statybos su 110 lovų. 1997 m. sausio 1 d. ligoninė reorganizuota į 2 savarankiškas sveikatos priežiūros įstaigas – Molėtų rajono centrinę ligoninę ir Molėtų rajono polikliniką, o visi ligoninės skyriai perkelti į vieną korpusą. Pirmoji ligoninės vadovė buvo gydytoja Marija Apeikytė. Ligoninei taip pat vadovavo gydytojai: Genė Kavoliūnienė, Juozas Žilinskas, Edmundas Bunza, Benediktas Valentinavičius, Rimas Lydekius, Stasys Bajerčius, Kęstutis Pangonis, Vygantas Saugūnas, Laimutė Daukienė. Nuo 2014-12-01 vadovauja gydytojas Vaidotas Grigas.
Šiuo metu ligoninėje yra 116 lovų. Ligoninė teikia diagnostikos, gydymo, slaugos ir palaikomojo gydymo paslaugas. Ligoninėje veikia Priėmimo – skubios pagalbos, Vidaus ligų, Slaugos ir palaikomojo gydymo skyriai, Fizinės medicinos ir reabilitacijos skyrius, Dantų protezavimo kabinetas, Konsultacijų poliklinika su dienos chirurgijos poskyriu, Laboratorja.
Šiuo metu ligoninėje dirba 161 darbuotojas.