Отделение хирургии печени и поджелудочной железы института Гастроэнтерологии АМН МЗ и СЗН Республики Таджикистан организовано приказом № 62 Министерства здравоохранения РТ от 07.02.2011 года. Являясь важнейшим подразделением головного учреждения Министерства здравоохранения и социальной защиты населения РТ в отделении хирургии печени и поджелудочной железы осуществляются специализированная хирургическая помощь населению Республики по широкому спектру заболеваний печени, поджелудочной железы и внепеченочных желчных протоков, как в плановом, так и в ургентном порядке. Главными направлениями научной и практической деятельности отделения являются разработки и совершенствование технологии резекции печени, поджелудочной железы и реконструктивно-восстановительных операций на внепеченочных желчных протоков. Ежедневно на отделении активно внедряются технологии малоинвазивных вмешательств органов брюшной полости, в частности гепатопанкреатодуоденальной зоны, рассматриваются научные разработки по хирургическому лечению осложненного холецистита, панкреатита, гепатоцеллюлярной карциномы на фоне цирроза печени и проблемы пищеводно-желудочного кровотечения. Неотъемлемой частью работы отделения является хирургическое лечение гигантских опухолей и кист органов брюшной полости, забрюшинного пространства, а также доброкачественных новообразований печени. Приоритетным направлением научной и практической деятельности сотрудников отделения остаются разработки оптимальных способов хирургического лечения паразитарных заболеваний печени ( эхинококкоз и альвеококкоз), кистозных трансформаций внепеченочных желчных протоков, заболеваний гепатопанкреатодуоденальной зоны осложненные синдромом механической желтухи и отдельных заболеваний крови. С момента открытия отделения населению РТ выполнено более 350 оперативных вмешательств, в том числе резекции печени (180), гепатопанкреатодуоденальных резекций (14) и формирование высоких билиодигестивных анастомозов (60). Инструментальная диагностика патологических новообразований печени, поджелудочной железы и внепеченочных желчных протоков основывается на данных УЗИ и ИО УЗИ, КТ, СКТ, МРТ, гепатосцинтиграфии, пункционной биопсии патологического очага с морфологическим заключением.