30/04/2026
Tato práce se zabývá bakteriálním regulačním systémem Csr/Rsm, ve kterém nekódující RNA aktivují translaci mRNA tím, že odstraňují proteiny Csr/Rsm z vazebných míst na ribozomu. U bakterie Pseudomonas protegens bylo zjištěno, že RNA RsmZ dokáže postupně vázat až pět dimerů proteinu RsmE a funguje jako „proteinová houba“. Vazba probíhá kooperativně, avšak navázání na místo s nejvyšší afinitou paradoxně snižuje afinitu dalšího vazebného místa, což představuje neobvyklou negativní kooperativitu. Tento jev může usnadňovat uvolnění proteinu RsmE z pevně vázané mRNA a jeho přenos na nekódující RNA. Pomocí metod izotermální titrační kalorimetrie, NMR spektroskopie a molekulové dynamiky byl odhalen alosterický mechanismus připomínající Newtonovu kolébku, který propojuje vazebná místa a vysvětluje sníženou afinitu při druhé vazbě proteinu.
https://www.nature.com/articles/s41467-026-72126-z