23/02/2026
Test respiratoire ou analyse des selles du microbiote : quelle différence et lequel choisir ?
Le choix est vite fait !
Les troubles digestifs (ballonnements, douleurs abdominales, transit irrégulier, intolérances alimentaires…) poussent de plus en plus de personnes à explorer leur microbiote intestinal.
Deux approches reviennent souvent : le test respiratoire et l’analyse des selles du microbiote.
Mais ces deux examens n’ont ni le même objectif, ni la même portée.
Voici un article clair pour comprendre les différences avec un focus particulier sur le test respiratoire,beaucoup plus pertinent en cas de symptômes digestifs fonctionnels.
Le test respiratoire : une analyse fonctionnelle et dynamique
Le test respiratoire (souvent utilisé pour rechercher un SIBO) consiste à analyser les gaz présents dans l’air expiré après ingestion d’un sucre spécifique (glucose ou lactulose).
Le principe est simple :
Certaines bactéries produisent de l’hydrogène ou du méthane lorsqu’elles fermentent des sucres.
Ces gaz passent dans le sang puis sont éliminés par les poumons. On peut donc les mesurer dans le souffle.
Ce que le test respiratoire met réellement en valeur
• Une fermentation anormale dans l’intestin grêle
• Une suspicion de SIBO (Small Intestinal Bacterial Overgrowth)
• Certaines malabsorptions de sucres
• Le type de gaz prédominant (hydrogène ou méthane), utile pour orienter la prise en charge
• Dysbiose du colon
• Problème de vidange gastrique
Ce test est dit fonctionnel car il observe une réaction en temps réel :
on voit comment votre système digestif réagit à un substrat précis.
Il est non invasif, simple à réaliser et particulièrement intéressant chez les personnes présentant :
• Ballonnements après les repas
• Gaz excessifs
• Alternance diarrhée/constipation
• Sensibilité digestive persistante
Par exemple, le test proposé par Bactanalyse s’inscrit dans cette approche ciblée sur les troubles digestifs et les déséquilibres fermentaires.
L’analyse des selles du microbiote : une photographie plus générale
L’analyse des selles repose sur le séquençage génétique des bactéries présentes dans un échantillon.
Elle permet d’obtenir :
• La liste des bactéries détectées
• Leur abondance relative
• Un indice de diversité microbienne
On obtient donc une cartographie du microbiote colique.maus pour en faire quoi ?
À part un coût très élevé ça ne fait qu’enrichir les laboratoires et leurs prescripteurs.
À l’heure actuelle impossible de cibler les souches avec des probiotiques.
En plus , il est important de comprendre plusieurs limites :
• Il s’agit d’une photo statique, pas d’un test fonctionnel
• Les résultats peuvent varier selon les laboratoires
• L’interprétation clinique reste complexe
• Ce type d’analyse ne permet pas de diagnostiquer directement un SIBO ni même de donner un traitement pour la dysbiose.
En pratique, cette approche coûte chère et ne sert qu’à prescrire des probiotiques non spécifiques on peut donc s’en passer!
