Γνάθιον (Gnathion)

14/01/2026

FREE SURGICAL PLANNER: ΤΡΙΑ ΕΠΙΠΕΔΑ ΛΗΨΗΣ ΓΙΑ ΚΑΘΕ ΤΥΠΟ ΧΡΗΣΤΗ. / THREE DOWNLOAD OPTIONS FOR EVERY TYPE OF USER.

Το project Free Surgical Planner, έχοντας ήδη ξεπεράσει τα 100 downloads από την πρώτη του παρουσίαση (12/10/2025), ολοκληρώνει την πρώτη δοκιμαστική φάση και παρουσιάζει πλέον τρεις διαφορετικούς τύπους λήψης/εγκατάστασης, προσαρμοσμένους στο επίπεδο υπολογιστικής κατάρτισης του χρήστη.

1. Λήψη Εφαρμογής (Application Download)

Απευθύνεται στον απλό χρήστη που δεν έχει εμπειρία με περιβάλλοντα προγραμματισμού. Σε αυτή την περίπτωση, ο χρήστης κατεβάζει και χρησιμοποιεί την έτοιμη εφαρμογή Slicer‑FSP, η οποία περιλαμβάνει όλα τα modules του Free Surgical Planner και βασίζεται στη σταθερή έκδοση 3D Slicer 5.10.0. Το μόνο που απαιτείται είναι η εγκατάσταση ορισμένων επιπλέον extensions μέσα από την ίδια την εφαρμογή.

2. Λήψη Modules (Modules Download)

Απευθύνεται στον προχωρημένο χρήστη με βασικές γνώσεις Python. Ο χρήστης ακολουθεί τις ήδη διαθέσιμες οδηγίες — τον τρόπο που μέχρι σήμερα αποτελούσε και τη μοναδική μέθοδο εγκατάστασης του Free Surgical Planner. Τα modules μπορούν να χρησιμοποιηθούν σε οποιαδήποτε πρόσφατη έκδοση του 3D Slicer.

3. Λήψη Πηγαίου Κώδικα (Source Code Download)

Απευθύνεται στον προγραμματιστή που επιθυμεί να χρησιμοποιήσει, να επεκτείνει ή να τροποποιήσει τον κώδικα για τις ανάγκες του δικού του project. Προσφέρει πλήρη πρόσβαση στη δομή και τη λειτουργικότητα του Slicer-FSP.

Πού θα τα βρείτε

Στο site 'https://freesurgplan.edu.gr/' μπορείτε να επιλέξετε τον τύπο λήψης είτε μέσω του μενού Downloads → Application / Modules / Source, είτε κάνοντας κλικ σε ένα από τα τρία διαθέσιμα buttons στην κεντρική σελίδα.

----------------------------------------------------------------------

Σημείωση:
Η εφαρμογή Slicer‑FSP είναι προς το παρόν διαθέσιμη μόνο για περιβάλλον Windows. Η υποστήριξη για macOS και Linux θα προστεθεί σε επόμενη έκδοση.

-----------------------------------------------------------------------

Δηλώστε συμμετοχή στη δημόσια ομαδα 'SPOT – Surgical Planning Open Team' ('https://www.facebook.com/groups/824256947020414') και συμμετέχετε ενεργά στην εξέλιξη του project.

-----------------------------------------------------------------------
The Free Surgical Planner project, having already surpassed 100 downloads since its first presentation (12/10/2025), successfully completes its initial testing phase and now introduces three distinct download/installation options, tailored to the user’s level of computational experience.

1. Application Download

Designed for users with no programming background. In this case, the user downloads and runs the ready‑to‑use Slicer‑FSP application, which includes all Free Surgical Planner modules and is built on the stable 3D Slicer 5.10.0 release. The only additional step required is installing a few necessary extensions directly from within the application.

2. Modules Download

Intended for advanced users familiar with basic Python programming. The user follows the existing instructions — the same method that, until now, was the primary way to install and use the Free Surgical Planner. These modules can be used with any recent version of 3D Slicer.

3. Source Code Download

Targeted at developers who wish to use, test, or modify the code for their own projects. This option provides full access to the structure and functionality of the Slicer-FSP.

Where to Download

On the website 'https://freesurgplan.edu.gr/', you can choose the preferred download type either through the menu Downloads → Application / Modules / Source, or by clicking one of the three available buttons on the main page.

--------------------------------------------------------------------
Note:
The Slicer‑FSP application is currently available only for Windows.
Support for macOS and Linux will be added in a future release.

---------------------------------------------------------------------

Join the public group 'SPOT – Surgical Planning Open Team' ('https://www.facebook.com/groups/824256947020414') and actively participate in the development of the project.

15/11/2025

FREE SURGICAL PLANNER FOR DENTAL: ΝΕΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΑ ΚΑΙ ΒΕΛΤΙΩΣΕΙΣ ΣΤΟ “DENTAL IMPLANT IMAGING " MODULE

Η δυναμική 2D και 3D επεξεργασία εικόνων αποτελεί βασικό εργαλείο στη διάγνωση και στον σχεδιασμό θεραπείας, ειδικά στα οδοντικά εμφυτεύματα. Παράλληλα, οι παραδοσιακές μορφές παρουσίασης (φιλμ, PDF) εξακολουθούν να έχουν σημαντικό ρόλο στην κλινική πράξη με CBCT.

Τα νέα χαρακτηριστικά του module συνδυάζουν τη διαδραστική επεξεργασία με την παραδοσιακή έξοδο των τομών ενδιαφέροντος, προσφέροντας πιο ολοκληρωμένη κλινική χρήση.

ΝΕΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΑ
1. Ρύθμιση απόστασης τομών για πιο ευκρινή και στοχευμένη απεικόνιση.
2. Εξαγωγή επιλεγμένων τομών σε PNG και PDF για επικοινωνία με συναδέλφους, αρχειοθέτηση ή εκτύπωση.

ΠΕΡΙΓΡΑΦΗ
• Δημιουργία καμπύλης στην περιοχή ενδιαφέροντος.
• Ρύθμιση της απόστασης των κάθετων τομών.
• Επεξεργασία και επιλογή τομών για τοποθέτηση εμφυτευμάτων ή μελέτη βλαβών.
• Εμφάνιση διαδραστικού layout με τις επιλεγμένες τομές για διεγχειρητική προβολή.
• Εξαγωγή των επιλεγμένων τομών σε PNG εικόνες και PDF report.

ΒΕΛΤΙΩΣΕΙΣ
• Μεγαλύτερες διαστάσεις προβολής τομών για πιο άνετη και αποτελεσματική χρήση.

UPDATE
Η αναβάθμιση είναι διαθέσιμη για download από την ίδια πηγή. Εγκατάσταση στον ίδιο φάκελο όπως και η προηγούμενη έκδοση.

---------------------------------------------------------------------

FREE SURGICAL PLANNER FOR DENTAL: NEW FEATURES AND IMPROVEMENTS IN THE “DENTAL IMPLANT IMAGING " MODULE

Dynamic 2D and 3D image processing is essential for diagnosis and treatment planning, especially in dental implantology. At the same time, traditional formats (film, PDF) remain widely used in CBCT clinical workflows.

The new features aim to combine interactive image processing with conventional output of selected slices, providing a more comprehensive clinical toolset.

NEW FEATURES
1. Adjustable slice spacing for clearer and more precise visualization.
2. Export of selected slices to PNG and PDF for communication, archiving, or printing.

WORKFLOW DESCRIPTION
• Define a curve along the region of interest.
• Adjust the spacing of perpendicular slices.
• Process and select slices for implant placement or lesion evaluation.
• Display an interactive layout of selected slices for intraoperative visualization.
• Export selected slices to PNG images and PDF reports.

IMPROVEMENTS
• Increased slice display dimensions to enhance usability and clinical clarity.

UPDATE
The upgrade is available for download from the same source. Install in the same folder as the previous version.

09/11/2025

ΠΩΣ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΓΙΝΕΙ Η ΚΑΤΑΤΜΗΣΗ ΤΟΥ ΒΛΕΝΝΟΓΟΝΟΥ ΤΗΣ ΝΩΔΗΣ ΑΝΩ ΓΝΑΘΟΥ ΚΑΙ Η ΑΥΤΟΜΑΤΗ ΕΥΘΥΓΡΑΜΜΙΣΗ ΤΟΥ ΜΕ ΤΟ ΜΟΝΤΕΛΟ ΣΑΡΩΣΗΣ;

HOW TO SEGMENT MUCOSA OF EDENTULOUS MAXILLA AND AUTOMATICALLY ALIGN IT TO THE SCAN MODEL?

Προς το παρόν δεν υπάρχει δυνατότητα αυτόματης κατάτμησης των ούλων και του βλεννογόνου των γνάθων.
Στο βίντεο περιγράφεται μια μέθοδος ημιαυτόματης κατάτμησης του βλεννογόνου μιας άνω γνάθου και στη συνέχεια η χρησιμοποίησή του για την ευθυγράμμιση με το μοντέλο της σάρωσης.

Currently, there is no automatic segmentation capability for the gums and mucosa of the jaws. The video describes a method for semi-automatic segmentation of the mucosa of an upper jaw and then using it to align with the scan model.

Workflow / Ροή Εργασίας

1. CBCT Acquisition
CBCT με τολύπια βάμβακος στις προστομιακές αύλακες / with cotton rolls in the buccal sulci

2. Import Data
File > Add DICOM Data

3. Dental Segmentator
Apply

4. Segment Editor
Add segment: “Upper Mucosa”
Threshold → Use for masking
Surface cut → Edit → Apply
Islands
Logical operators (Add): “Upper Mucosa” + “Upper Teeth”

5. Dental Implant Imaging
Dental Segmentator Models

6. FastModelAlign
Source Model: edentulous-upperjaw
Target Model: Upper Mucosa
Apply scaling: uncheck
Output registered model: Create new Model
Point Density Adjustment: 1.8
Run rigid registration

06/11/2025

DIGITAL WORKFLOW FROM CBCT TO SURGICAL GUIDE USING FREE AND OPEN SOURCE SOFTWARE

Σε αυτό το βίντεο περιέχονται σε μια ενότητα όλα τα επιμέρους 3 βήματα της ψηφιακής ροής εργασίας του ‘Free Surgical Planner for Dental’, που έχουν ήδη αναρτηθεί, και επιπλέον έχει προστεθεί το βήμα της σχεδίασης του χειρουργικού οδηγού.

Οπότε μπορούμε να περιηγηθούμε σε οποιοδήποτε χρονικό σημείο της διαδικασίας, από την εισαγωγή των αρχείων DICOM μέχρι και την σχεδίαση του χειρουργικού οδηγού, χωρίς να χρειάζεται να αλλάζουμε βίντεο.

Έχουμε όλη την διαδικασία σε ένα βίντεο διάρκειας 70 λεπτών με την εξής χρονική ακολουθία:

0:00:06 Step I. Data Preparation(DICOM, Segmentation, Slice)
0:12:40 Step II. Model Registration and Refinement
0:34:24 Step III. Prosthetically-driven Implant Placement
0:53:02 How to Design a Dental Implant Surgical Guide

Υπενθυμίζουμε ότι η ψηφιακή ροή εργασίας που παρουσιάζεται βασίζεται σε ελεύθερο λογισμικό/λογισμικό ανοικτού κώδικα και βασίζεται στο συνδυασμό 5 python scripted modules και 6 extensions του 3D Slicer.

Οδηγίες εγκατάστασης και χρήσης υπάρχουν στις αναρτήσεις:
https://www.facebook.com/groups/824256947020414/posts/824952350284207
https://www.facebook.com/groups/824256947020414/posts/824949796951129

This video contains in one section all the individual 3 steps of the digital workflow of the ‘Free Surgical Planner for Dental’, which have already been posted, and in addition the step of designing the surgical guide has been added.

So we can navigate to any point in the process, from importing the DICOM files to designing the surgical guide, without having to change videos.

We have the entire process in a 70-minute video with the following time sequence:

0:00:06 Step I. Data Preparation(DICOM, Segmentation, Slice)
0:12:40 Step II. Model Registration and Refinement
0:34:24 Step III. Prosthetically-driven Implant Placement
0:53:02 How to Design a Dental Implant Surgical Guide

Please note that the digital workflow presented is based on free and open source software and is based on the combination of 5 python scripted modules and 6 3D Slicer extensions.

Installation and usage instructions are available in the posts:
https://www.facebook.com/groups/824256947020414/posts/824952350284207
https://www.facebook.com/groups/824256947020414/posts/824949796951129

01/11/2025

SPOT - SURGICAL PLANNING OPEN TEAM / ΑΝΟΙΚΤΗ ΟΜΑΔΑ ΧΕΙΡΟΥΡΓΙΚΟΥ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΥ

Η υπολογιστική καθοδήγηση, παρέχοντας μεγαλύτερη ακρίβεια, έλεγχο και ασφάλεια, κερδίζει ολοένα έδαφος στην χειρουργική, αλλά η πρόσβαση σε αξιόπιστα ψηφιακά εργαλεία παραμένει περιορισμένη λόγω κόστους και τεχνικών περιορισμών.

Η «Ανοιχτή Ομάδα Χειρουργικού Σχεδιασμού» είναι μια δημόσια ομάδα με σκοπό την διερεύνηση εναλλακτικών ελεύθερου λογισμικού για χειρουργικό σχεδιασμό, τοποθέτηση εμφυτευμάτων και ψηφιακή αποκατάσταση.

Συμμετέχετε στην «Ανοιχτή Ομάδα Χειρουργικού Σχεδιασμού». Συνεργαστείτε, μοιραστείτε γνώσεις και χτίστε το μέλλον της χειρουργικής αποκατάστασης.

Αν είστε ερευνητής, κλινικός, προγραμματιστής ή φοιτητής με πάθος για την καινοτομία — αυτή η ομάδα είναι για εσάς!

Μοιραζόμαστε ιδέες, έρευνα, εργαλεία και ροές εργασίας που διευρύνουν τα όρια της καινοτομίας και της προσβασιμότητας στην υγειονομική περίθαλψη.

Το ελεύθερο λογισμικό αλλάζει ριζικά την υπολογιστικά καθοδηγούμενη οδοντική εμφυτευματολογία:
• Καταρρίπτει οικονομικά και τεχνικά εμπόδια.
• Θέτει ισχυρά εργαλεία σχεδιασμού στα χέρια των κλινικών.
• Ενθαρρύνει μια παγκόσμια κοινότητα καινοτομίας.

Υποστηρίζουμε την ελευθερία δεδομένων, τη συνεργασία και τη διαφάνεια — όχι μόνο επειδή μειώνουν το κόστος, αλλά γιατί κάνουν τον σχεδιασμό πιο προσβάσιμο, προσαρμόσιμο και αξιόπιστο — «εκδημοκρατίζοντας» έναν τομέα που κυρίως προορίζεται για όσους έχουν την οικονομική ευχέρεια για εμπορικά/ιδιόκτητα συστήματα.

Η δημόσια προβολή της ομάδας αντικατοπτρίζει τη δέσμευσή μας στη διαφάνεια, τη συνεργασία και την ελεύθερη ανταλλαγή γνώσεων μεταξύ των πεδίων της ιατρικής, της μηχανικής και της επιστήμης των υπολογιστών που ολοένα συγκλίνουν.

Μπορείτε να παρακολουθείτε τις αναρτήσεις, τα βίντεο και όποιο άλλο περιεχόμενο της δημόσιας ομάδας SPOT, ακόμη και αν δεν είστε μέλος.

Για να συμμετέχετε ενεργά σε συζητήσεις ή να δημοσιεύσετε το δικό σας περιεχόμενο, απλά πατήστε το κουμπί «Γίνετε μέλος της ομάδας».

Σύνδεσμος Ομάδας: https://www.facebook.com/groups/824256947020414

, , , , , , , , , ,

22/10/2025

FREE SURGICAL PLANNER FOR DENTAL

Ελεύθερα modules για την υπολογιστικά καθοδηγούμενη οδοντική εμφυτευματολογία.
Δείτε τα χαρακτηριστικά και κατεβάστε τα modules: https://freesurgplan.edu.gr

, , , , , , , ,

11/10/2025

“FREE SURGICAL PLANNER”: ΕΛΕΥΘΕΡΟ ΛΟΓΙΣΜΙΚΟ ΑΝΟΙΚΤΟΥ ΚΩΔΙΚΑ ΓΙΑ ΧΕΙΡΟΥΡΓΙΚΟ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟ.

Το «Γνάθιον» παρουσιάζει modules ελεύθερου λογισμικού ανοικτού κώδικα για τον σχεδιασμό επεμβάσεων στοματικής και γναθοπροσωπικής χειρουργικής.
Τα modules σχεδιάστηκαν στην πλατφόρμα 3D Slicer και έχουν γραφτεί σε Python, προσφέροντας πλήρη δυνατότητα τροποποίησης και ελεύθερης διανομής.

Τα πρώτα τέσσερα modules αποτελούν μέρος του “Free Surgical Planner for Dental”. Είναι δίγλωσσα (Ελληνικά/Αγγλικά) και καλύπτουν την ψηφιακή ροή εργασίας από την εισαγωγή των εικόνων DICOM έως την προσθετικά καθοδηγούμενη προσομοίωση τοποθέτησης εμφυτευμάτων, περιλαμβάνοντας χαρακτηριστικά που δεν υπάρχουν στα εμπορικά λογισμικά.

Δείτε videos με οδηγίες εγκατάστασης και χρήσης στον ιστότοπο: https://www.freesurgplan.edu.gr/

“FREE SURGICAL PLANNER”: FREE AND OPEN SOURCE SOFTWARE FOR SURGICAL PLANNING.

“Gnathion” presents free and open source software modules for planning oral and maxillofacial surgery procedures. Built on the 3D Slicer platform and written in Python, these tools are fully customizable and freely shareable.

The first four modules are part of the “Free Surgical Planner for Dental”. They are bilingual (Greek/English) and cover the digital workflow from DICOM image import to prosthetically-driven implant placement simulation, including features not found in commercial software.

Watch videos with installation and usage details at: https://www.freesurgplan.edu.gr/

28/04/2025

ΑΠΟΛΟΓΙΣΜΟΣ

Το «Δημιουργώντας module ελεύθερου λογισμικού / λογισμικού ανοικτού κώδικα για το σχέδιο θεραπείας οδοντικών εμφυτευμάτων» ήταν ένα ερευνητικό project με αντικείμενο τη δυναμική η οποία μπορεί να προκύψει όταν η ιατρική/οδοντιατρική επιστήμη συνεργαστεί με την υπολογιστική επιστήμη.

Κάποιος/α γιατρός με βασικές αλλά πανεπιστημιακά (στην περίπτωσή μας πανεπιστήμιο Πατρών) πιστοποιημένες γνώσεις στη γλώσσα προγραμματισμού Python και την Μηχανική Μάθηση επιχειρεί να δημιουργήσει λογισμικό το οποίο να είναι χρήσιμο στην καθημερινή πρακτική.

Τα αποτελέσματα φαίνονται στα δυο video(πρώτο και δεύτερο μέρος).

Το module δεν θα ανεβεί στο github γιατί πρόθεση των δημιουργών δεν είναι ο ανταγωνισμός με τα εμπορικά λογισμικά. Ωστόσο για τμήματα του κώδικα που θα μπορούσαν να ενδιαφέρουν μπορεί να υπάρξει σχετική συνεννόηση στο info@gnathion.gr

Ελάχιστα είναι ακόμη τα πανεπιστήμια που δίνουν στους φοιτητές της ιατρικής τη δυνατότητα της διασταυρούμενης εκπαίδευσης με μηχανικές και υπολογιστικές επιστήμες(Stanford University, Harvard University, ETH Zurich, University College London (UCL)). Το αποτέλεσμα είναι ότι με την αποφοίτηση εκτός από την κύρια επιστήμη υπάρχει μια δεύτερη αλλά πιστοποιημένη(πχ μηχανική λογισμικού).

Νομίζω ότι και στην Ελλάδα μπορούν να γίνουν τέτοιες διεπιστημονικές συνεργασίες. Οπωσδήποτε υπάρχουν ανασφάλειες, περιχαρακώσεις και οικονομικά συμφέροντα. Αλλά το συμφέρον της εκπαίδευσης είναι το πρώτιστo αγαθό. Δεν είναι δυνατόν την εποχή του ΑΙ ένας απόφοιτος πανεπιστημίου να μη γνωρίζει ούτε Python.

22/04/2025

ΔΗΜΙΟΥΡΓΩΝΤΑΣ MODULE ΕΛΕΥΘΕΡΟΥ ΛΟΓΙΣΜΙΚΟΥ/ ΛΟΓΙΣΜΙΚΟΥ ΑΝΟΙΚΤΟΥ ΚΩΔΙΚΑ ΓΙΑ ΤΟ ΣΧΕΔΙΟ ΘΕΡΑΠΕΙΑΣ ΟΔΟΝΤΙΚΩΝ ΕΜΦΥΤΕΥΜΑΤΩΝ.

ΜΕΡΟΣ 2: ΣΧΕΔΙΑΣΗ ΚΑΙ ΕΚΤΥΠΩΣΗ ΧΕΙΡΟΥΡΓΙΚΟΥ ΟΔΗΓΟΥ

ΧΡΟΝΙΑ ΠΟΛΛΑ!

Σε συνέχεια με το πρώτο μέρος, αυτό το video αφορά τον σχεδιασμό του χειρουργικού οδηγού μέχρι και την εκτύπωσή του.
Το video είναι στα ελληνικά και έχει αγγλικούς υπότιτλους.

(Following on from the first part, this video concerns the design of the surgical guide up to its printing.)
(The video is in Greek and it has English subtitles.)

Σε συνέχεια με το πρώτο μέρος, αυτό το video αφορά τον σχεδιασμό του χειρουργικού οδηγού μέχρι και την εκτύπωσή του.Το video είναι στα ελληνικά και έχει αγγλ...

04/04/2025

ΔΗΜΙΟΥΡΓΩΝΤΑΣ MODULE ΕΛΕΥΘΕΡΟΥ ΛΟΓΙΣΜΙΚΟΥ/ ΛΟΓΙΣΜΙΚΟΥ ΑΝΟΙΚΤΟΥ ΚΩΔΙΚΑ ΓΙΑ ΤΟ ΣΧΕΔΙΟ ΘΕΡΑΠΕΙΑΣ ΟΔΟΝΤΙΚΩΝ ΕΜΦΥΤΕΥΜΑΤΩΝ.

ΜΕΡΟΣ 1: ΕΙΣΑΓΩΓΗ DICOM ΚΑΙ ΣΧΕΔΙΑΣΗ ΤΟΠΟΘΕΤΗΣΗΣ

Στο video γίνεται μια πρώτη παρουσίαση από τη διαμόρφωση ενός module ελεύθερου λογισμικού/ λογισμικού ανοιχτού κώδικα για τον σχεδιασμό τοποθέτησης οδοντικών εμφυτευμάτων. Θα ακολουθήσουν και άλλες σχετικές παρουσιάσεις με τελικό στόχο την δημιουργία μιας ελεύθερης και ολοκληρωμένης εφαρμογής στον τομέα της υπολογιστικά καθοδηγούμενης εμφυτευματoλογίας.
Το video είναι στα ελληνικά και έχει αγγλικούς υπότιτλους.

(This video provides a first presentation of the development of a free and open source software module for the placement of dental implants. Other relevant presentations will follow with the ultimate goal of creating a free and comprehensive application in the field of computer-guided implantology.
The video is in Greek and it has English subtitles.)

Στο video γίνεται μια πρώτη παρουσίαση από τη διαμόρφωση ενός module ελεύθερου λογισμικού/ λογισμικού ανοιχτού κώδικα για τον σχεδιασμό τοποθέτησης οδοντικών...

27/12/2024

2025: ΤΕΧΝΗΤΗ ΝΟΗΜΟΣΥΝΗ ΚΑΙ ΚΛΙΝΙΚΗ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΟΤΗΤΑ

Μπαίνοντας στο 2025, έχουμε ήδη τη δυνατότητα να αξιοποιήσουμε αρκετά αυτοματοποιημένα μοντέλα ελεύθερου λογισμικού/λογισμικού ανοικού κώδικα(ΕΛ/ΛΑΚ) για την κατάτμηση(segmentation) της ανατομίας κεφαλής και τραχήλου, του στόματος και των δοντιών. Τα περισσότερα παρουσιάστηκαν την χρονιά που πέρασε.

Αναφέρουμε 4 από αυτά με τα σχετικά links. Τα μοντέλα μπορούν να χρησιμοποιηθούν και να δοκιμαστούν μέαα από την ανοικτή πλατφόρμα του 3D Slicer(ΕΛ/ΛΑΚ), είτε χωριστά το καθένα, είτε συνδυαστικά:

1. AMASSS module στο AutomatedDentalTools extension.(https://github.com/DCBIA-OrthoLab/SlicerAutomatedDentalTools)

2. MONAI Auto3DSeg (Το Whole Head Segmentation model για facial muscle segmentation).
(https://github.com/Project-MONAI/tutorials/blob/main/auto3dseg/README.md)

3. DentalSegmentator extension.
(https://github.com/gaudot/SlicerDentalSegmentator)

4. TotalSegmentator extension (Περιέχει μοντέλα για τους μυς, τα οστά και τα αγγεία κεφαλής και τραχήλου).
(https://github.com/wasserth/TotalSegmentator)

Στο πρόσφατο πανελλήνιο Οδοντιατρικό συνέδριο παρουσιάσαμε την κλινική εμπειρία μας από τον χειρουργικό σχεδιασμό μετά την χρησιμοποίηση των μοντέλων AMASSS και DentalSegmentator.

Το ερώτημα αν η αυτοματοποιημένη κατάτμηση μπορεί να θεωρηθεί αξιόπιστο και ακριβές βήμα στην πραγματική κλινική πράξη μένει ακόμη να απαντηθεί με περισσότερη έρευνα και βελτίωση των μοντέλων.

Γεγονός είναι ότι τα μοντέλα εμπλουτίζονται διαρκώς με νέα πιο σύνθετα δεδομένα και πιο αποτελεσματικές μεθόδους, όπως συνέβη με το nnU-Net και βέβαια το Auto3DSeg που δημιουργήθηκε από το project του MONAI(Medical open network for AI) που τρέχει σε συνεργασία της Nvidia με το αμερικανικό National Institutes of Health (NIH) και το King's College London.

Το 2025, η πρόοδος στα μοντέλα της κατάτμησης θα επιταχυνθεί και είναι πολύ πιθανό, αν όχι βέβαιο, ότι θα έχουμε και μοντέλο για τον βλεννογόνο του στόματος και τα ούλα. Μια εξέλιξη που θα επηρεάσει σημαντικά την ψηφιακή ροή εργασίας στον χειρουργικό σχεδιασμό. Και όχι μόνο.

Παραθέτουμε μια σχετική βιβλιογραφία και για τυχόν διευκρινίσεις, βοήθεια ή και συμμετοχή στη διαμόρφωση των μοντέλων επικοινωνήστε στο info@gnathion.gr.

ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

Dot G, Chaurasia A, Dubois G, Savoldelli C, Haghighat S, Azimian S, Taramsari AR, Sivaramakrishnan G, Issa J, Dubey A, Schouman T, Gajny L. DentalSegmentator: Robust open source deep learning-based CT and CBCT image segmentation. J Dent. 2024 Aug;147:105130

Fedorov A., Beichel R., Kalpathy-Cramer J., Finet J., Fillion-Robin J-C., Pujol S., Bauer C., Jennings D., Fennessy F.M., Sonka M., Buatti J., Aylward S.R., Miller J.V., Pieper S., Kikinis R. 3D Slicer as an Image Computing Platform for the Quantitative Imaging Network. Magnetic Resonance Imaging. 2012

Gillot M, Baquero B, Le C, Deleat-Besson R, Bianchi J, Ruellas A, Gurgel M, Yatabe M, Al Turkestani N, Najarian K, Soroushmehr R, Pieper S, Kikinis R, Paniagua B, Gryak J, Ioshida M, Massaro C, Gomes L, Oh H, Evangelista K, Chaves Junior CM, Garib D, Costa F, Benavides E, Soki F, Fillion-Robin JC, Joshi H, Cevidanes L, Prieto JC. Automatic multi-anatomical skull structure segmentation of cone-beam computed tomography scans using 3D UNETR. PLoS One. 2022 Oct 12;17(10):e0275033.

Isensee F, Jaeger PF, Kohl SAA, Petersen J, Maier-Hein KH. nnU-Net: a self-configuring method for deep learning-based biomedical image segmentation. Nat Methods. 2021 Feb;18(2):203-211.

Isensee, Fabian & Petersen, Jens & Klein, André & Zimmerer, David & Jaeger, Paul & Kohl, Simon & Wasserthal, Jakob & Koehler, Gregor & Norajitra, Tobias & Wirkert, S. & Maier-Hein, Klaus. (2019). Abstract: nnU-Net: Self-adapting Framework for U-Net-Based Medical Image Segmentation. 10.1007/978-3-658-25326-4_7.

Ryan ML, Wang S, Pandya SR. Integrating Artificial Intelligence Into the Visualization and Modeling of Three-Dimensional Anatomy in Pediatric Surgical Patients. J Pediatr Surg. 2024 Dec;59(12):161629

Wasserthal J, Breit HC, Meyer MT, Pradella M, Hinck D, Sauter AW, Heye T, Boll DT, Cyriac J, Yang S, Bach M, Segeroth M. TotalSegmentator: Robust Segmentation of 104 Anatomic Structures in CT Images. Radiol Artif Intell. 2023 Jul 5;5(5):e230024.

Zheng F, Yin P, Liang K, Wang Y, Hao W, Hao Q, Hong N. Fusion Radiomics-Based Prediction of Response to Neoadjuvant Chemotherapy for Osteosarcoma. Acad Radiol. 2024 Jun;31(6):2444-2455

01/11/2024

ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΚΟΣΤΟΣ ΟΔΟΝΤΙΑΤΡΙΚΗΣ ΘΕΡΑΠΕΙΑΣ

Στο φετινό 42ο Πανελλήνιο Οδοντιατρικό Συνέδριο παρουσιάστηκε έρευνα-δημοσκόπηση της Ελληνικής Οδοντιατρικής Ομοσπονδίας με τίτλο «Το επίπεδο της στοματικής υγείας και η ποιότητα της οδοντιατρικής περίθαλψης των Ελλήνων» σύμφωνα με την οποία σχεδόν 1 στους 5 Έλληνες δεν πηγαίνουν στον οδοντίατρο λόγω οικονομικής αδυναμίας να καλύψουν την θεραπεία.

Στις παραγωγικές ηλικίες, 25-64 ετών, η αναλογία της οικονομικής αδυναμίας μεγαλώνει και κυμαίνεται από τον 1 στους 4 μέχρι και τον 1 στους 3.

Ειδικότερα, στην Αττική 1 στους 3 (33,3%) επί του συνόλου του ηλικιών δεν μπορεί να επισκεφθεί οδοντίατρο λόγω οικονομικής αδυναμίας παρότι μόλις το 21,2% δηλώνει ότι δεν αντιμετωπίζει κάποιο οδοντιατρικό πρόβλημα.

Από τη μια η οικονομική αδυναμία μεγάλου τμήματος της κοινωνίας να έχει και να διατηρεί καλή στοματική υγεία και από την άλλη το ολοένα αυξανόμενο κόστος λειτουργίας του οδοντιατρικού επαγγέλματος, που στην χώρα μας ασκείται σχεδόν αποκλειστικά σε ιδιωτική βάση χωρίς καμία ουσιαστική κρατική υποστήριξη, είναι δύο συντελεστές που όσο δεν ρυθμίζονται κατάλληλα θα κρατούν την εξίσωση χωρίς βιώσιμη λύση.

Τα ιδιωτικά ιατρεία στο βαθμό των δυνατοτήτων τους προσπαθούν να κρατήσουν τις τιμές σταθερές παρά την αύξηση του κόστους λειτουργίας. Το γεγονός αυτό φαίνεται και από τα στοιχεία της ΕΛΣΤΑΤ για τον Δείκτη Τιμών Καταναλωτή (ΔΤΚ) στον τομέα της υγείας σε σχέση με την αύξηση του ετήσιου πληθωρισμού που έχουμε μετά την επιδημία του Covid-19.

Ειδικότερα στον τομέα των οδοντικών εμφυτευμάτων παρότι η ζήτηση αυξάνεται οι ασθενείς στην πλειονότητά τους δεν μπορούν να ανταποκριθούν στο κόστος αυτής της θεραπείας.

Σε αυτό το πλαίσιο, η πρόοδος της τεχνολογίας μπορεί και πρέπει να είναι ένας σύμμαχος στην προσπάθεια για τη μείωση του κόστους και την βελτίωση της ποιότητας στην θεραπεία και την αποκατάσταση. Αυτή η κατεύθυνση μπορεί να συμβάλλει, έστω μερικά, στην αντιμετώπιση του προβλήματος.

Οι καινοτόμες εφαρμογές των νέων τεχνολογιών μπορούν και πρέπει να μειώνουν το κόστος και να βελτιώνουν την ποιότητα της παρεχόμενης υπηρεσίας για τον οδοντίατρο και τον ασθενή. Αλλοιώς δεν ομιλούμε για ‘4η βιομηχανική επανάσταση’, αλλά απλά για πρόσθετες οικονομικές επιβαρύνσεις στις ήδη υπάρχουσες ή ελαφρά τροποποιημένες συμβατικές μεθόδους – μια συνθήκη που όχι μόνο δεν ανταποκρίνεται στις ανάγκες της κοινωνίας, αλλά αντίθετα απομακρύνεται ακόμη περισσότερο από αυτές και προάγει την ανισότητα στην αγορά και την παροχή των οδοντιατρικών υπηρεσιών.