25/09/2024
Wrzesień dobiega powoli końca, a tymczasem my dalej zagłębiamy się w tematy naukowe w naszej Akademii Cytolab! Dziś trzeci etap wielu badań genetycznych czyli... rozdział elektroforetyczny!
Jak pamiętacie w ostatnim poście gdzie pisaliśmy o reakcji PCR, pojawiło się takie określenie jak startery. Należy tutaj wspomnieć że do każdego badania używane są inne zestawy starterów. Dlaczego? Dlatego że zazwyczaj zależy nam nie na powieleniu całego materiału genetycznego, ale jego fragmentów zawierających konkretne geny.
Wyjaśnijmy sobie to w taki sposób.
W naszym badaniu zależy nam na ustaleniu czy pacjent posiada trzy geny, A, B i C. każdy z tych genów jest kodowany przez konkretny fragment DNA, więc startery dajemy takie, aby przyłączały się w okolicach interesujących nas genów, aby doszło do powielenia tylko tego konkretnego fragmentu. Taki zabieg umożliwia nam następnie przeprowadzenie rozdziału badanego materiału na drodze elektroforezy. Jak?
Przygotowujemy specjalny żel z agarozy, w którym są dołki. Do dołków nakładamy materiał który poddaliśmy reakcji PCR. Fragmenty DNA które będziemy badać będą miały różną długość, np dla Genu A będą długie na 150 par zasad, dla Genu B na 300 par zasad, a dla genu C 500 par zasad. Żel razem z próbkami umieszczamy w specjalnym roztworze, w wanience, na której obu końcach są elektrody. Puszczamy przez nie prąd, który płynie od "minusa" do "plusa". Przepływający prąd powoduje też przesuwanie się naszych próbek w żelu, im krótszy fragment DNA, tym szybciej przepływa on przez żel, a im dłuższy tym wolniej. Po pewnym czasie sprawdzamy w świetle UV, jak daleko przesunęły się nasze próbki, co obserwujemy w postaci świecących się prążków. Jeżeli prążek pojawi się na wysokości, na którą migrują fragmenty o długości 150 par zasad, to mamy obecny Gen A, jeżeli na wysokość 300 par zasad, Gen B, a jeżeli na wysokość 500 par zasad, mamy Gen C!
To wszystko może brzmieć niezrozumiale, jednak z grubsza tak właśnie wygląda nasza praca ;) a my staramy się ją państwu jak najprzystępniej i prosto wyjaśnić. To wszystko na dziś, zapraszamy za tydzień!
