Wojskowy Instytut Higieny i Epidemiologii jest unikalnym w skali MON i kraju instytutem badawczym merytorycznie, kadrowo i organizacyjnie przygotowanym do prowadzenia na rzecz resortu Obrony Narodowej oraz innych instytucji państwowych działalności badawczej, zapobiegawczej, szkoleniowej i usługowej w zakresie skutków zdrowotnych i sposobów przeciwdziałania chorobom wywołanym BRONIĄ MASOWEGO RAŻEN
IA:
biologiczną
chemiczną
radiologiczną
nuklearną
a także promieniowaniem niejonizującym
W tym zakresie, Instytut prowadzi działalność zgodnie z zaleceniami i standardami Organizacji Traktatu Północnoatlantyckiego oraz współdziała z członkami NATO i Unią Europejską w tworzeniu międzynarodowego systemu przeciwdziałania broni masowego rażenia. W szczególności, WIHiE jest uznanym ośrodkiem badawczym i opiniotwórczym w dziedzinie obrony przed bronią biologiczną. klasy bezpieczeństwa biologicznego (BSL-3), w którym można rozpoznawać i badać bakterie i toksyny wywołujące takie choroby jak:
wąglik
dżuma
cholera
tularemia
zatrucie jadem kiełbasianym i inne,
które mogą być użyte w czasie ataku bio-terrorystycznego i/lub stanowić ognisko groźnych epidemii. W tym zakresie Instytut ściśle współdziała z Biurem Bezpieczeństwa Narodowego, Państwową Inspekcją Sanitarną, Inspekcją Sanitarną MSWiA, a także organizacjami pozarządowymi (np. Przeciwdziałania Terroryzmowi i Zagrożeniom Biologicznym).