Hệ thống chẩn đoán, điều trị khép kín với nhiều trang thiết bị hiện đại vào loại bậc nhất trong nước và khu vực như: Hệ thống điều trị bằng chùm gia tốc tuyến tính ( Cyberknife ) của Hãng Acuray - Mỹ có thể điều trị các khối u trong cơ thể không cần phẫu thuật, PET- CT, máy chụp cộng hưởng từ MRI Phillip 1.5 và 3.0 Tes, Máy chụp CT xoắn ốc 320 slices, hệ thống chụp mạch DSA, máy chụp xạ hình SPECT
, Hệ thống phá sỏi ngoài cơ thể thế hệ mới, hệ thống siêu âm, nội soi và nhiều máy xét nghiệm tự động hiện đại. Bệnh viện có nhiều Viện, Trung tâm, và Chuyên khoa sâu triển khai các kỹ thuật cao, giải quyết nhiều mặt bệnh phức tạp : Viện Chấn thương Chỉnh hình Quân đội, Viện Lâm sàng các bệnh nhiệt đới, Viện Tim mạch Quân đội, Trung tâm Cyberknife, Trung tâm Đột quỵ não, Trung tâm ghép tuỷ, Trung tâm Nội soi, mới đây là Trung tâm máy Gia tốc ( Cyclotron ) sản xuất các dược chất phóng xạ, Khoa Can thiệp tim mạch, Labo Sinh học phân tử v.v...
