Trước đây rất lâu, tỉnh Long Xuyên không có thầy thuốc. Trước năm 1907, cứ mỗi tháng hai lần, có một thầy thuốc từ Cần Thơ, hay nếu ông này vắng mặt, thì một thầy thuốc từ Châu Đốc đến Long Xuyên khám bệnh. Vào thời kỳ này, một thư ký kế toán Tòa Bố chịu trách nhiệm phòng thuốc; một y tá người bản xứ, không bằng cấp chuyên môn, được tuyển mộ tại chỗ, đảm trách công việc của một bệnh xá. Hai lần mỗi năm có một thầy thuốc tiêm chủng đến khám.
Năm 1903, ông Liêu Tường Thái đã hiến một mảnh đất trên nền bệnh viện hiện nay để cất ” Nhà Bảo Sanh ”
Ngày 07/ 04/ 1907, người dân hiến đất thêm để mở rộng thành cơ sở y tế; lần đầu tiên một thầy thuốc - Bác Sĩ Pujat, được bổ nhiệm đến Long Xuyên và có thể bác sĩ Pujat chính là vị Giám đốc đầu tiên của bệnh viện (đến năm 1913 bác sĩ Hostalrich được chuyển đến và có thể là vị Giám đốc thứ hai). Lúc bấy giờ, bệnh viện chỉ có trại khám ngoại chẩn và buồng bệnh cho phụ nữ.
Năm 1910 bệnh viện có thêm trại bệnh cho đàn ông; chỗ ở cho nhân viên: một cho các dì phước và năm cho các y tá; một nhà tranh cho các bệnh cách ly; một nhà bảo sanh và các nhà phụ. Về sau được cất thêm trại bệnh cho người bị sốt, nhà bảo sanh thu phí, nhà xác, và kho đồ vải.
Đến năm 1913 bệnh viện đặt bia đá kỷ niệm.
Năm 1925, bệnh viện được cất hẳn một trại bệnh cách ly gồm 6 buồng nhỏ, mỗi buồng 2 giường.
Năm 1926, hạt nhân của bệnh viện là một phòng mổ hiện đại và phòng thanh trùng, mỗi tháng thực hiện được 15 ca phẫu thuật các loại.
Thế nhưng trận hỏa hoạn năm 1945 đã thiêu rụi một số dãy nhà nên sau đó bệnh viện được xây cất lại.
Theo lời bà Nguyễn Thị Sen (cô Bảy Sen) cựu Nữ Hộ Sinh, Trưởng Khoa Sản đã công tác liên tục từ năm 1948 đến khi về hưu năm 1982 thì vào năm 1948 Khoa Sản có bác sĩ Nhuận làm việc chánh thức và một bác sĩ làm tư là bác sĩ Lữ thỉnh thoảng được mời tham vấn, có 3 Nữ Hộ Sinh Đông Dương tốt nghiệp tại Sài Gòn.
Trước năm 1975, bệnh viện được đặt tên là “Bịnh Viện Long Xuyên” rồi “ Trung Tâm Y Tế Toàn Khoa Long Xuyên”. Lúc ấy bệnh viện có 420 giường với 4 bác sĩ làm bán thời gian. Mặt tiền bệnh viện lúc ấy vẫn còn được giữ như vậy tới nay. Bệnh Viện Trưởng lúc này là bác sĩ Thình, quản lý tất cả các vấn đề hành chánh, nhân sự, tài chánh, và phụ trách điều trị các trại bệnh Nội khoa; ngoài ra ông còn trông coi tất cả các hoạt động y tế khác ngoài bệnh viện bao gồm công tác vệ sinh và phòng bệnh lây nhiễm bởi vì tất cả các chương trình y tế nông thôn (lúc ấy) đều do bệnh viện tỉnh phụ trách.
Phụ trách Ngoại khoa là bác sĩ Bàn, đã từng nghỉ hưu nhưng lại được lưu dụng vì bệnh viện thiếu bác sĩ trầm trọng.
Bác sĩ Nhì phụ trách Sản phụ khoa. Bác sĩ Bích phụ trách Nhi khoa và tiếp giúp bác sĩ Thình trông coi trại Nội khoa.
Lực lượng cán sự điều dưỡng chỉ có 3 người được huấn luyện 3 năm tại bệnh viện Chợ Rẫy. Có một số tá viên điều dưỡng được huấn luyện 1 năm tại bệnh y. Ngoài ra còn một số “ học sinh y tá” tình nguyện làm việc để học nghề, không hưởng lương, không được bố trí chổ ăn ở. Họ chỉ có được quyền lợi là sau 2 năm sẽ được ưu tiên thu dụng nếu có chổ trống, để làm việc tại bệnh viện tỉnh hay các trạm xá huyện.
Công tác chăm sóc sản phụ và trẻ em chiếm phần lớn công việc và có vẻ tiến bộ nhất trong các hoạt động y tế, nhờ có sự trợ giúp của Liên Hiệp Quốc thông qua cơ quan UNICEF. Những Nữ Hộ Sinh Quốc Gia được huấn luyện 3 năm tại Sài Gòn. Ngoài ra còn một số Tá Viên Hộ Sinh học 2 năm và Cô Đỡ Hương Thôn học 1 năm tại bệnh viện tỉnh. Sau khóa học, các Cô Đỡ Hương Thôn sẽ được trang bị một bộ dụng cụ đỡ đẻ về phục vụ tại các Nhà Hộ Sinh xã- ấp trong toàn tỉnh.
Sau năm 1975, bệnh viện không ngừng được cải tạo và xây dựng mới trên tổng diện tích 2,4 ha. Trung tâm được đổi tên thành Bệnh viện Đa khoa An Giang rồi sau đó đổi tên thành Bệnh viện Đa khoa Trung tâm An Giang.
Lúc này bệnh viện có 500 giường sau đó tăng lên 650 giường, đến năm 2002 bệnh viện có 754 giường. Từ năm 2005, bệnh viện có số giường là 900, tổng số nhân sự là 984 người, trình độ đại học là 213 người.
Hiện nay, Bệnh viện Đa khoa Trung tâm An Giang được di dời qua địa chỉ mới tại 60 Ung Văn Khiêm từ năm 2016 để đảm bảo nhu cầu phát triển. Được xây dựng trên khu đất 4,6 héc- ta, diện tích xây dựng 12.806m2, với khu nhà chính cao 10 tầng, gồm 25 khoa lâm sàng, 6 khoa cận lâm sàng và 8 phòng chức năng; có 1166 giường bệnh, tổng nhân sự là 1037 người, trình độ đại học và sau đại học là 309 người; công trình có mật độ xây dựng 28%, cây xanh 35% Bệnh viện được đầu tư các trang thiết bị y tế hiện đại như: Máy MSCT 160 lát cắt, MRI 3.0 Tesla, Phòng DSA số hoá xoá nền hiện đại nhất khu vực ĐBSCL, máy phẫu thuật nội soi, đo loãng xương, hệ thống xét nghiệm đạt chuẩn quốc tế duy nhất ở ĐBSCL… đảm bảo phục vụ tốt nhất cho công tác chăm sóc sức khỏe của nhân dân. Đây là bệnh viện đầu tiên ở ĐBSCL có sân bay trực thăng phục vụ cấp cứu.
